摘要： 目的 旨在应用宏基因组下一代测序（mNGS）技术,解析临床病原学未明的严重急性呼吸道感染（SARI）病例的病原谱特征,为精准诊疗提供参考依据。方法 收集29例广东省临床诊断为SARI但常规病原学检测阴性的患者咽拭子样本,采用mNGS技术进行深度测序,所得原始序列经质控、去除宿主源序列后,通过生物信息学方法进行病原微生物鉴定与丰度分析。采用χ²检验对不同人群亚组间的病原体检出率差异进行统计学分析。结果 mNGS检测结果显示,细菌是检出率最高的病原体,其中以口腔放线菌（96.55%）等条件致病菌为主;真菌中,多形着色霉等检出率较高（96.55%）。病毒的总体检出率较低,75.86%（22/29）的样本未检出明确的致病性病毒。分层分析发现,儿童组的检出病原体数量显著低于青年组（P<0.01）和中老年组（P<0.05）。不同年龄组的优势菌群亦存在差异,具核梭杆菌在青年组中更为常见（84.62%）,而白色念珠菌在老年组中的检出率更高（45.45%）。与轻症组相比,中症组患者的病原体种类及典型呼吸道病原体的检出率均呈上升趋势,但差异无统计学意义（P>0.05）。结论 mNGS技术可有效识别传统方法难以检出的SARI病例的复杂与混合感染模式。SARI患者的病原谱构成具有显著的年龄异质性,除关注典型呼吸道病毒外,口腔定植菌群及真菌在疾病进程中的潜在作用亦需重视。

关键词: 宏基因组测序, 严重急性呼吸道感染, 病原谱

中图分类号: 

• R563