华南预防医学 ›› 2021, Vol. 47 ›› Issue (3): 359-362.doi: 10.12183/j.scjpm.2021.0359

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2019年珠海市登革病毒流行情况及E基因演化分析

林毅雄, 魏泉德, 黄辉涛, 阮峰, 倪锡河   

  1. 珠海市疾病预防控制中心,广东 珠海 519000
  • 收稿日期:2020-03-04 出版日期:2021-03-20 发布日期:2021-04-14
  • 作者简介:林毅雄(1981—),男,硕士研究生,副主任技师,主要从事分子生物学研究工作
  • 基金资助:
    广东省医学科学技术研究基因项目(A2017491)

  • Received:2020-03-04 Online:2021-03-20 Published:2021-04-14

摘要: 目的 通过对2019年珠海市登革热流行病学数据及及登革病毒包膜蛋白基因(E基因)序列进行分析,了解珠海市登革热流行规律和病毒遗传进化特点。方法 2019年珠海疾病预防控制中心采集登革热临床诊断病例的血液标本,对病例进行流行病学调查,磁珠法提取病毒核酸,用Real-time RT-PCR进行检测,阳性标本用RT-PCR扩增E基因并进行测序分型获得的基因序列,采用MEGA6.0软件进行系统进化分析。结果 共收集登革热临床诊断病例185例,实验室诊断病例99例,实验室诊断病例较2018年同期增长154%。其中输入性病例53例,本地感染病例46例,男性61例,女性38例,进入9月份本地感染病例增多,以散发状态为主,其中本地暴发疫情2起;75例成功测序,以DENV-1型为主,占88.00%,全部属于基因Ⅰ亚型,分布在3个不同分支上,分别与2017年越南、2015柬埔寨、2014年马来西亚、新加坡,2012、2014年斯里兰卡等流行株高度同源;DENV-2和DENV-3病例均为输入病例。结论 珠海市登革热主要由东南亚输入,极易发生输入性病例引起本地暴发流行,定期对流行的登革病毒进行序列分析有利于分析该病毒的基因进化方向。

关键词: 登革病毒, 包膜蛋白基因, 序列分析

中图分类号: 

  • R115