摘要： 目的 探讨2022年云南省手足口病病例中5株柯萨奇病毒B1型（Coxsackievirus B1,CVB1）分离株的基因组特征及遗传进化关系。方法 采用病毒分离、基因测序及生物信息学方法,对分离株进行全长基因组序列测定与分析。结合GenBank数据库中CVB1参考株序列,构建系统发育树并进行重组分析。结果 5株云南CVB1分离株基因组核苷酸同源性高（≥98.1%）,均属于E基因型,与其他CVB1参考株的核苷酸和氨基酸同源性分别为79.94%~90.74%和94.27%~98.08%。系统进化和重组分析表明,在P1~P2区域,5株云南分离株与国内CVB1分离株亲缘关系较近;但在2C、3A等非结构蛋白编码区与肠道病毒B组其他血清型（如埃可病毒E11）存在重组事件。结论 2022年云南省CVB1分离株为中国大陆主要流行的E基因型,其进化过程中在非结构蛋白编码区与部分肠道病毒B组其他血清型发生多个重组事件。

关键词: 柯萨奇病毒B组1型, 全基因组序列, 遗传特征

中图分类号: 

• R373.23